Действие игры Fallout 3 происходит в постапокалиптическом мире 2077 года, спустя 36 лет после событий, имевших место быть во второй части. Мир вокруг полон еще большей злости и жестокости. Персонаж, за которого вам предстоит играть не тот, что был в предыдущей части. Главный герой рос и воспитывался в убежище № 1, никогда прежде, сколько себя помнил, он не видел внешнего мира после ядерной катастрофы и не знал людей, выходящих оттуда. Лишь его отец покинул убежище и никогда больше не возвращался, что вызвало недоумение и ряд вопросов. Вам нужно отправиться на поиски отца и понять, зачем он решил уйти в мир, полный опасностей.